Geboren in Weingarten / Württemberg, Schauspielausbildung in München an der Otto-Falckenberg-Schule. Fast ihre gesamte künstlerische Karriere hat sie in Österreich verbracht. Als Ensemblemitglied am Theater in der Josefstadt, Schauspielhaus Wien, Volkstheater und Landestheater Niederösterreich. Als Gast an den Hamburger Kammerspielen und bei den Wiener Festwochen. Zahlreiche Kino- und Fernsehfilme für ARD, ZDF und ORF (u.a. Die Klavierspielerin, Tatort, Julia). Zusammenarbeit mit den Regisseuren: Luc Bondy, Michael Haneke, Wolfgang Glück, Harald Sicheritz, Michael Verhoeven, Wolfgang Murnberger, Xaver Schwarzenberger. Ihre Soloabende widmet sie österreichischen Autorinnen der Gegenwart: Ilse Aichinger, Ingeborg Bachmann, Hertha Kräftner oder Friederike Mayröcker.
Cornelia Köndgen lebt mit dem Schauspieler und Sänger Ludwig Hirsch und dem gemeinsamen Sohn Moritz in Wien und in der Steiermark. Zuletzt zu sehen im Landestheater Niederösterreich in Dora Schneiders Inszenierung Fette Männer im Rock von Nicky Silver und in Ray Cooneys Außer Kontrolle und in Werner Schwabs "Die Präsidentinnen" als Mariedl.